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1. 基于特征聚类和随机子空间的microRNA识别方法
芮志良, 朱玉全, 耿霞, 陈耿
计算机应用    2015, 35 (2): 374-377.   DOI: 10.11772/j.issn.1001-9081.2015.02.0374
摘要488)      PDF (644KB)(367)    收藏

针对microRNA识别方法中过多注重新特征、忽略弱分类能力特征和冗余特征,导致敏感性和特异性指标不佳或两者不平衡的问题,提出一种基于特征聚类和随机子空间的集成算法CLUSTER-RS。该算法采用信息增益率剔除部分弱分类能力的特征后,利用信息熵度量特征之间相关性,对特征进行聚类,再从每个特征簇中随机选取等量特征组成特征集用于构建基分类器,最后将基分类器集成用于microRNA识别。通过调整参数、选择基分类器实现算法最优化后,在microRNA最新数据集上与经典方法Triplet-SVM、miPred、MiPred、microPred和HuntMi进行对比实验,结果显示CLUSTER-RS在识别中敏感性不及microPred但优于其他模型,特异性为六者最优,而且从整体性能指标准确性和马修兹系数可以看出,CLUSTER-RS比其他算法具有优势。结果表明,CLUSTER-RS取得了较好的识别效果,在敏感性和特异性上实现了很好的平衡,即在性能指标平衡方面优于对比方法。

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2. 移动环境下基于共享客户信息的空间位置查询
孙小培 朱玉全 陈耿 桑丘
计算机应用    2009, 29 (12): 3293-3295.  
摘要1464)      PDF (461KB)(1033)    收藏
针对移动环境下空间位置查询不能及时得到响应等问题,提出了一种基于最共享邻近客户信息的空间位置查询算法(SRNN)。该算法充分利用客户本身所具有的通信和计算能力,共享周围客户的信息,减轻了中心服务器的负担,同时降低了移动客户的等待时间。实验结果表明,SRNN算法是可行有效的。
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3. 一种分布式序列模式挖掘算法
常鹏 陈;耿 朱玉全
计算机应用   
摘要1787)      PDF (786KB)(1412)    收藏
针对分布式环境下的序列模式挖掘问题,提出了一种分布式序列模式挖掘(DSPM)算法。DSPM以PrefixSpan算法为基础,使用抽样检测技术平衡了任务负载,将挖掘任务分解后分配到多台计算机上以多进程、多线程并行执行。另外采用了伪投影技术来降低生成投影数据库的开销。实验结果表明,DSPM算法能够快速有效地挖掘分布式环境下的全局序列模式。
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4. 面向移动计算环境的单连接查询处理模式研究
王敏 朱玉全 张春芬
计算机应用   
摘要1628)      收藏
在移动计算环境下,基于准确的操作代价估算结果来选择合适的连接查询处理模式,可以减少数据的传输量和移动设备的能量消耗。探讨了该环境下移动设备能量消耗的一个新的非对称特征,提出了一种操作代价估算方法,并从数据传输量和能量消耗两个方面对连接查询处理模式进行了代价估算和性能比较,提出了4个实用准则,以指导连接查询处理模式的选择。试验结果充分论证了估算方法和准则的正确性,且比现有同类估算模型和结论具有更加广泛的应用范围。
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